More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2400 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  47.28 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  48.94 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  45.67 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  46.48 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  46.48 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  42.3 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  44.82 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  45.67 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  46.23 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  39.87 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  45.73 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  42.04 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  40.66 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 		 343 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  37.28 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 359 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 		 2762 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  26.13 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  27.4 
 
 		 282 aa  96.3  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  27.4 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 360 aa  89.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  26.42 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 272 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  31.34 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  32.5 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.63 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>