More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2772 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  55.52 
 
 
311 aa  339  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  54.87 
 
 
311 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  61.4 
 
 
339 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  54.15 
 
 
299 aa  329  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  51.78 
 
 
305 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  50.88 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  51.62 
 
 
305 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  55.13 
 
 
309 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  54.66 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 
297 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  50.16 
 
 
325 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  52.41 
 
 
307 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  52.68 
 
 
297 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  53.27 
 
 
307 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  51.02 
 
 
340 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  51.02 
 
 
349 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  51.02 
 
 
300 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  51.02 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  51.02 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  51.02 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  50.68 
 
 
296 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  50.68 
 
 
296 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  50 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  51.36 
 
 
296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
296 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
296 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
296 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
296 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  49.34 
 
 
294 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
302 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  49.34 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  42.9 
 
 
289 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  44.15 
 
 
300 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  44.82 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  42.02 
 
 
295 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
289 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 
292 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
289 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.83 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
289 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28.76 
 
 
282 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28.43 
 
 
282 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.69 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
294 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.84 
 
 
2762 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  38.22 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  32.56 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  28.21 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  29.08 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  27.37 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.42 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37.93 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  33.93 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  28.94 
 
 
607 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  33.33 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
290 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  28.04 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
360 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  38.27 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  41.98 
 
 
262 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
287 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.7 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>