More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1589 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
343 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  69.3 
 
 
313 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  61.7 
 
 
299 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  59.77 
 
 
311 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  59.65 
 
 
311 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  57.43 
 
 
309 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
325 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  57.73 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  50.88 
 
 
312 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  46.45 
 
 
305 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 
305 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 
297 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  47.34 
 
 
307 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 
297 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 
339 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  43.45 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  43.45 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  43.28 
 
 
296 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 
300 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 
296 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 
296 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 
296 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  44.05 
 
 
294 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 
296 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
296 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
296 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  42.56 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  43.03 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  43.45 
 
 
296 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
296 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
296 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 
302 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 
295 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 
289 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
300 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 
309 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
292 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 
285 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
327 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.37 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.1 
 
 
2762 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  25.4 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.65 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 
290 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  26.65 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  25.57 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
282 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  23.75 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  23.3 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  22.51 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
308 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  21.86 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
288 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  22.97 
 
 
283 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  23.46 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  26.52 
 
 
246 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
243 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
297 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
286 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 
328 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  24.12 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  30 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  22.77 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>