117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5050 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  81.25 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3254  alpha/beta hydrolase fold  79.42 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5114  alpha/beta hydrolase fold  79.42 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  80.42 
 
 		 246 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  66.53 
 
 		 243 aa  317  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3124  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 		 247 aa  238  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_003296  RS03059  putative esterase protein  41.18 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1962  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  38.24 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  33.08 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  35 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 290 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  46.38 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 299 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  33.68 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  39.45 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  27.56 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 310 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  22.34 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  33.68 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14941  Alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0521265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.94 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  26.44 
 
 		 473 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.69 
 
 		 343 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  34.86 
 
 		 341 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 504 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.27 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  29.29 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  29.02 
 
 		 341 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  35.35 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.33 
 
 		 13537 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.62 
 
 		 443 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 296 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.16 
 
 		 448 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>