93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3176 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 305 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  66.23 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  63.61 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  58.21 
 
 		 339 aa  338  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  54.61 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  54.46 
 
 		 353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  52.75 
 
 		 324 aa  319  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  56.42 
 
 		 318 aa  315  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  55.23 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  56.16 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  54.51 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  52.22 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  50 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  46.9 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  45.64 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  43.41 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  43.46 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  43.81 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  42.66 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  41.72 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  40.57 
 
 		 364 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  40.76 
 
 		 364 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  40.57 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  40.57 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  40.57 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  39.81 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 289 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  39.31 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  39.31 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  39.31 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  39.06 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  38.8 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  39.31 
 
 		 367 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  39.38 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  38.99 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  38.99 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  38.99 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  38.99 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  38.99 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  38.99 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  37.54 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  40.43 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  38.18 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.43 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  40.37 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.63 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  36.21 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  26.22 
 
 		 394 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.5 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  32.88 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  28.37 
 
 		 413 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  26.95 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  27.66 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  29.17 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  29.29 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  35 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  31.88 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  26.24 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  26.24 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  32.74 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  28.99 
 
 		 645 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  24.26 
 
 		 688 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  28.99 
 
 		 645 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  27.5 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  27.5 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  27.5 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  26.9 
 
 		 681 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  35.42 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3254  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5114  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.93 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  26.5 
 
 		 728 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.51 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  31.62 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.99 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  23.53 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  24.4 
 
 		 681 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  24.4 
 
 		 681 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>