81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003806 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  87.38 
 
 
353 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  75.56 
 
 
339 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  63.07 
 
 
305 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  56.63 
 
 
323 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  62.79 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  58.56 
 
 
305 aa  345  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  54.61 
 
 
305 aa  338  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  56.62 
 
 
311 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  58.42 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  54.43 
 
 
324 aa  335  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  55.96 
 
 
311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  53.95 
 
 
309 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  53.22 
 
 
308 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  50.53 
 
 
309 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 
351 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  45.67 
 
 
332 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  46.51 
 
 
332 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 
364 aa  229  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  42.13 
 
 
359 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  42.12 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  43.3 
 
 
364 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  43.3 
 
 
364 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  43.3 
 
 
364 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  43.57 
 
 
364 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  43.65 
 
 
364 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  42.37 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  43.88 
 
 
296 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  43.3 
 
 
294 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  43.26 
 
 
360 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  43.26 
 
 
360 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
296 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  43.26 
 
 
364 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
289 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  40.06 
 
 
315 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
296 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  41.74 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
377 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  41.12 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  40.06 
 
 
365 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  41.21 
 
 
364 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  40.62 
 
 
377 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  40.99 
 
 
341 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 
299 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  30 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.43 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  36.54 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.12 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.54 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  27.14 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  30.77 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  24.11 
 
 
681 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  29.08 
 
 
413 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  29.45 
 
 
413 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  28.67 
 
 
413 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  28.67 
 
 
413 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  27.66 
 
 
413 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  27.66 
 
 
413 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.55 
 
 
225 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  28.21 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  34.62 
 
 
281 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.71 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  35.16 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  23.46 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  29.2 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  31.76 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.24 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  29.57 
 
 
400 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28.45 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  30.89 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  29.81 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  29.77 
 
 
264 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.93 
 
 
217 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>