81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3012 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  100 
 
 		 314 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  44.59 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  46.01 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  44.49 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  50.96 
 
 		 257 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  45.64 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  43.53 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  42.47 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  40.49 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  39.07 
 
 		 280 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  41.15 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  38.64 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  41.67 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  35.4 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  36.27 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  39.37 
 
 		 573 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.67 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  33.05 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  30.71 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  32.73 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  29.96 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  32.7 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  29.5 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  32.26 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.55 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.95 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  29.38 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  28.65 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  29.7 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  30 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  28.65 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.59 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  38.05 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  26.61 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  26.18 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  30.99 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  28.26 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  36.46 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  36.46 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  36.46 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  36.46 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  36.46 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  36.46 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  36.46 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  35.85 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  25.93 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  31.15 
 
 		 414 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  34.38 
 
 		 364 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  35.42 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  33.04 
 
 		 2169 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  25.31 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  33.64 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  35.42 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.36 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  31.76 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  33.64 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  37.78 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  35.42 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  34.38 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  35.42 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  35.42 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  35.42 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  33.67 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  34.78 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  34.38 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  35.29 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  24.46 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  37.93 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.7 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  31.25 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  30.83 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>