63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1065 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  47.91 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  44.66 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  32 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  33.99 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  31.98 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  31.19 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  32 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  32.86 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  30.49 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  34.67 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  33.5 
 
 		 265 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  33.99 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  31.13 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  30.81 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  26.32 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  31.13 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  26.67 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  28.1 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  28.24 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  29.38 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  37.62 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  34.34 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  32.29 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3706  putative lipase transmembrane protein  31.39 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  28 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  29.6 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  28 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  29.41 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  35.05 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  26.83 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  29.67 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  29.2 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  36.11 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  27.68 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  29.41 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  33 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 571 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.91 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  24.66 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  29.19 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  28.95 
 
 		 353 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.18 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  59.38 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  27.6 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.84 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  27.83 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  27.83 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  27.83 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  38 
 
 		 364 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>