106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3796 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  100 
 
 		 377 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  49.23 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  46.29 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  46.29 
 
 		 364 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  45.36 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  44.93 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  44.26 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  45.77 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  45.77 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  45.77 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  45.77 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  45.77 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  45.77 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  43.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  43.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  43.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  43.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  43.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  43.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  43.24 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  43.57 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  46.87 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  40.74 
 
 		 353 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  41.25 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  39.69 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  41.07 
 
 		 309 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  40.74 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  44.19 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  39.08 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 351 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  42.64 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  38.39 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  38.7 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  35.49 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  38.51 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.26 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  32.39 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  33.02 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 296 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 359 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  27.64 
 
 		 299 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.78 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.72 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  43.86 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  27.45 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  26.61 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  32.94 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  24.57 
 
 		 643 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  28.4 
 
 		 645 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  28.4 
 
 		 645 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  24.73 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  28.04 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  31.11 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  26.34 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  29.05 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  27.51 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  26.74 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  26.74 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  29.05 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  28.5 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  28.49 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  28.49 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  30.05 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  28.49 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0871  hypothetical protein  25.17 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0893  esterase, putative  25.17 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  32.09 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  31.9 
 
 		 281 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  35.71 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.21 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  33.02 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.59 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.5 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2819  Triacylglycerol lipase  29.41 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  46.15 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.59 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  34.45 
 
 		 587 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  27.41 
 
 		 589 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  34.26 
 
 		 303 aa  46.2  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  34.51 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  30.17 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0450  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.29 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  34.26 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  25.2 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  29.37 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  27.78 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  30 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  30.83 
 
 		 547 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>