76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4854 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 315 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  99.66 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  95.95 
 
 		 296 aa  583  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  93.24 
 
 		 296 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  73.31 
 
 		 296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  51.69 
 
 		 294 aa  269  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  48.83 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  46.05 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  46.78 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  45.36 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  46.74 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  43.09 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  40.06 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  43.34 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  41.78 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  40.54 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  43.3 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  39.39 
 
 		 309 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  38.33 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  38.33 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  36.53 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  36.53 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  36.53 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  35.63 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  35.28 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 377 aa  148  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  34.27 
 
 		 364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  34.78 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  34.78 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  34.78 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  33.96 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  36.31 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  35.42 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.45 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  35.09 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  35.09 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  35.09 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  35.09 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  36.06 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  26.74 
 
 		 561 aa  62.4  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  34.38 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.27 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  35.09 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  26.01 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.28 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  34.31 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  31.85 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  27.41 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.44 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  33.62 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.62 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  40 
 
 		 114 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  29.46 
 
 		 222 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.33 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.95 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  34.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  30.77 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.36 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  36.47 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  36.84 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  34.07 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>