93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0301 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  86.57 
 
 
216 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  43.46 
 
 
255 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  45.12 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  43.66 
 
 
221 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  44.86 
 
 
221 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  42.25 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  44.86 
 
 
222 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  44.86 
 
 
241 aa  168  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  41.4 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  40.09 
 
 
268 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  41.9 
 
 
245 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  37.26 
 
 
255 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  38.32 
 
 
393 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  33.49 
 
 
254 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  36.28 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  31.16 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  29.52 
 
 
247 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  34.38 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.31 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  27 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.59 
 
 
249 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  31.94 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  27.78 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  26.61 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  31.08 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  30.73 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.44 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  28.26 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  29.73 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  29.63 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  24.88 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  25.47 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  32.69 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  34.71 
 
 
492 aa  52.4  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  26.51 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.13 
 
 
324 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.97 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  26.21 
 
 
294 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  32.11 
 
 
302 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  30.63 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  27.35 
 
 
313 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
311 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  28.23 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
296 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
349 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
296 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
311 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
296 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
296 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  39.66 
 
 
317 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  28.95 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  36.79 
 
 
1878 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.97 
 
 
334 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  30.83 
 
 
303 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
302 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  25.57 
 
 
276 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  28.95 
 
 
304 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  23.27 
 
 
264 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  31.25 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  22.97 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  34.43 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  34.15 
 
 
338 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  34.43 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  28.27 
 
 
415 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  26.97 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  30.83 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  28.12 
 
 
432 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  32 
 
 
327 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  32.46 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  32.43 
 
 
299 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  34.43 
 
 
332 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1128  hypothetical protein  23.42 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  34.43 
 
 
332 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.48 
 
 
298 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1647  hypothetical protein  28.83 
 
 
306 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.559763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1101  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  29.84 
 
 
958 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  28.33 
 
 
255 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  30.65 
 
 
364 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.85 
 
 
206 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
296 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24 
 
 
195 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>