43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2238 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  39.61 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  36.95 
 
 
210 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  38.73 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  37.96 
 
 
249 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  36.24 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  36.19 
 
 
393 aa  98.6  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  37.13 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  37.98 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  28.92 
 
 
204 aa  92  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  31.13 
 
 
393 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  29.77 
 
 
255 aa  89  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.02 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  31.6 
 
 
221 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  29.72 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.81 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.43 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  31.92 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  31.28 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  27.78 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  24.89 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  24.42 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  26.7 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  31.28 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  30.41 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  29.05 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  30.41 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  28.18 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  25.35 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.87 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.87 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  26.42 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  21.56 
 
 
325 aa  51.2  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  25.4 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  38.4 
 
 
298 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.92 
 
 
342 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  35.21 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0871  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0893  esterase, putative  30.77 
 
 
364 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  33.8 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  29.25 
 
 
284 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>