34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01554 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  58.71 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  37.38 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  36.45 
 
 		 393 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  37.13 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  26.83 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  31.03 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  36.62 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.07 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.71 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  28.3 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  30.94 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  36.16 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  31.82 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  30.6 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  29.38 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  31.08 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  33.04 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  36.62 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  27.15 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  25.74 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  28.3 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.91 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  22.12 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2931  hypothetical protein  28.99 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  34.62 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  27.78 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  24.19 
 
 		 203 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  34.38 
 
 		 361 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>