58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3532 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  51.85 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  49.3 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  43.87 
 
 		 268 aa  214  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  48.82 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  48.57 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  44.6 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  43.46 
 
 		 216 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  44.55 
 
 		 211 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  37.09 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  39.07 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  37.38 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  38.5 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  35.32 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  33.62 
 
 		 393 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  25.21 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  31.63 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  31.63 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  31.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  33.02 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  30.04 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  36.08 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  29.77 
 
 		 209 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.51 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.8 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  30.56 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  27.65 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.11 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  27.23 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  26.29 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  28.11 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.9 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  30.47 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  26.03 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1878 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  25.5 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  25.5 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  28.41 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.22 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  25.84 
 
 		 382 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.43 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  23.98 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.47 
 
 		 430 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  31.73 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  28.69 
 
 		 364 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.46 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  32.38 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  24.56 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  29.46 
 
 		 492 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1460 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  27.36 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 253 aa  42  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  27.05 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  27.97 
 
 		 324 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  25.96 
 
 		 294 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>