25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0108 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  36.59 
 
 
2159 aa  867    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  100 
 
 
1878 aa  3771    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  33.93 
 
 
1805 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  31.01 
 
 
1921 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  31.88 
 
 
1831 aa  558  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  31.6 
 
 
1937 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  32.82 
 
 
1460 aa  526  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  32.07 
 
 
933 aa  263  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  28.22 
 
 
487 aa  99.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  29 
 
 
1429 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
916 aa  52.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 
2741 aa  52.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.37 
 
 
532 aa  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
968 aa  51.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  23.04 
 
 
459 aa  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  51.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  26.7 
 
 
659 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  30.84 
 
 
1268 aa  50.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 
2741 aa  51.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  23.45 
 
 
457 aa  50.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  34.65 
 
 
268 aa  49.3  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  36.79 
 
 
216 aa  46.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  29.85 
 
 
615 aa  46.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  19.1 
 
 
854 aa  45.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  36.89 
 
 
216 aa  45.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>