53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0756 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  96.4 
 
 		 221 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  54.33 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  51.43 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  44.86 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  46.26 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  49.06 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  46.7 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  46.48 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  47.87 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  38.32 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  45.93 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  44.02 
 
 		 268 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  31.92 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 393 aa  111  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  30.84 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  35.21 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  27.7 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.24 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  31.94 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  39.76 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  33.49 
 
 		 393 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.44 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  31.6 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  30.18 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  28.19 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  29.63 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.44 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.77 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  22.22 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  32.88 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  34.26 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  28.9 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  33.96 
 
 		 338 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  32.48 
 
 		 313 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.93 
 
 		 382 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  33.02 
 
 		 338 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  30.28 
 
 		 415 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.65 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  33.33 
 
 		 324 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.45 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.19 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0985  hypothetical protein  24.11 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0380637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  32.56 
 
 		 958 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  31.67 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 343 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  40 
 
 		 2159 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  33.04 
 
 		 339 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 340 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  28.1 
 
 		 222 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>