120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1837 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  100 
 
 
334 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  46.31 
 
 
361 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  44.53 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  47.77 
 
 
286 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  40.08 
 
 
282 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  36.73 
 
 
284 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  34.84 
 
 
294 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.5 
 
 
298 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30 
 
 
276 aa  90.1  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  34.39 
 
 
313 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  30.28 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  30.28 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.62 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  34.21 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  33.55 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  34.21 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  32.02 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  26.12 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.16 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  33.93 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  29.22 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  38.4 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  31.29 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  39.52 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  37.9 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  37.9 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  30.63 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  25.62 
 
 
222 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.12 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.25 
 
 
222 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  36.84 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  27.56 
 
 
197 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.93 
 
 
203 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  26.6 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  27.81 
 
 
197 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  24.85 
 
 
203 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  26.6 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  31.82 
 
 
200 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  31.82 
 
 
200 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  36.59 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.3 
 
 
211 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  28.79 
 
 
194 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  24.53 
 
 
216 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  24.56 
 
 
211 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  29.41 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.49 
 
 
191 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  32.03 
 
 
191 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  26.92 
 
 
217 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.69 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.57 
 
 
205 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  28.1 
 
 
236 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  34.42 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  30.69 
 
 
216 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  22.76 
 
 
195 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  27.96 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  22.76 
 
 
195 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.31 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  27.46 
 
 
533 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  29.01 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  27.46 
 
 
533 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1955  hypothetical protein  27.46 
 
 
533 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  25.64 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  28.31 
 
 
206 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.18 
 
 
223 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  26.76 
 
 
533 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.9 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  27.46 
 
 
533 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  26.76 
 
 
533 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  27.46 
 
 
533 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  26.76 
 
 
533 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  26.76 
 
 
533 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  26.06 
 
 
547 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  25.86 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  31.5 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  42.65 
 
 
357 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  31.43 
 
 
255 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1995  PGAP1 family protein  26.76 
 
 
536 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0402712  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.97 
 
 
205 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  28.37 
 
 
393 aa  46.2  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  30.56 
 
 
195 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  31.58 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  28.14 
 
 
1381 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  36.19 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  28.07 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  28.97 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  28.36 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  30.97 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  32.23 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  41.44 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  36.11 
 
 
743 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.51 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.4 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
263 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>