143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5983 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  100 
 
 		 313 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  61.65 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  46.97 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  33.17 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  35.03 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.6 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.05 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  31.68 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  36.79 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  34.15 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  36.41 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  35.75 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  35.75 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  34.09 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  31.91 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  32.02 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  35.11 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  30.48 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  31.39 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  31.39 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.88 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.05 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  24.72 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.94 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.49 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  31.53 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  28.3 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  27.07 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  31.06 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.95 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  34.07 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  31.11 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  30.6 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  32.42 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  30.6 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  29.41 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  32.92 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  33.33 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  26.94 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.9 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  24.43 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  30.32 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.17 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.07 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.81 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.81 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  25.9 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  27.11 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  29.85 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  32.06 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  29.41 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.95 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  30.57 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  38.58 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.93 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  32.79 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.42 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.76 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  32.87 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  29.44 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  30 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  32.74 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  27.98 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  26.7 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  39.77 
 
 		 683 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  28.81 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  26.73 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  32 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  26.52 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  28.78 
 
 		 191 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  29.33 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  30.22 
 
 		 195 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  25.32 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  26.09 
 
 		 191 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 365 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  27.98 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  32.41 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  28.94 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  32.48 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  31.62 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  24.85 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  37.62 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  28.88 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.19 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  32.71 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  35.29 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  32.31 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  33.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  31.3 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0661  hypothetical protein  36.46 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  31.13 
 
 		 547 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  38.46 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  36.28 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  31.3 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  28.15 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  31.3 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  31.3 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  31.3 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  31.3 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>