70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1266 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  100 
 
 		 332 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  44.16 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  42.07 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  46.25 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  45.93 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  46.13 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  39.33 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  39.27 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  33.02 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  37.29 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  37.29 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  36.44 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.15 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.69 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  29.26 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.62 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.03 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  27.8 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.6 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  27.03 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  32.92 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  25.26 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  34.87 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  33.93 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.46 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  24.05 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  24.84 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  27.37 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.22 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  31.19 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.57 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  28.49 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  32.02 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  24.84 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  33.51 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  24.86 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.13 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  25.95 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.13 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  31.25 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.11 
 
 		 216 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.67 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.41 
 
 		 223 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.63 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  25.97 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  26.37 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  21.63 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.32 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  27.11 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  21.63 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  29.57 
 
 		 254 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  32.37 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  23.33 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  23.33 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  23.28 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  26.96 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.15 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  27.91 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  28.93 
 
 		 418 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  28.85 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.59 
 
 		 524 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  29.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  20.97 
 
 		 205 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  29.41 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.62 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.48 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  26.23 
 
 		 309 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  39.06 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>