112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3549 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  55 
 
 
216 aa  245  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  57.21 
 
 
206 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  58.73 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  58.73 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  33.85 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  32.12 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  35.48 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  28.42 
 
 
200 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  28.42 
 
 
200 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  28.72 
 
 
197 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  30.69 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  29.32 
 
 
191 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  30.3 
 
 
203 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.72 
 
 
203 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  29.32 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  29.23 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.29 
 
 
299 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30 
 
 
298 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  28.05 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.8 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  26.74 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.23 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  27.36 
 
 
276 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  30.81 
 
 
282 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  25.56 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  27.4 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.1 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  26.7 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  26.87 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  29.12 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.14 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  30.85 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  28.49 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.33 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  28.09 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  26.97 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  23.33 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  25.13 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  26.73 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  25.96 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.9 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  23.81 
 
 
339 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  29.7 
 
 
314 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  24.08 
 
 
302 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  33.04 
 
 
382 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  26.11 
 
 
311 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  25.63 
 
 
342 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.37 
 
 
430 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  30.21 
 
 
289 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.3 
 
 
334 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  20.9 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  28.19 
 
 
327 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  25.39 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  30.09 
 
 
357 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.15 
 
 
286 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  24.24 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  21.81 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  25.39 
 
 
338 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  25.64 
 
 
303 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.8 
 
 
293 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  23.83 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  23.24 
 
 
303 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  22.75 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  30.17 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  24.47 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  26.19 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  27.23 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.22 
 
 
285 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  21.13 
 
 
361 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  23.64 
 
 
240 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83712  predicted protein  28.95 
 
 
329 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  29.66 
 
 
367 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  28.81 
 
 
367 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  28.81 
 
 
367 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  28.81 
 
 
367 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  28.81 
 
 
367 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.12 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  45.1 
 
 
474 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1128  hypothetical protein  24.6 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  28.49 
 
 
573 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
365 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  21.84 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
273 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  27.06 
 
 
362 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  26.52 
 
 
415 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  28.81 
 
 
367 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  28.81 
 
 
367 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  28.81 
 
 
367 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  29.09 
 
 
364 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  27.12 
 
 
303 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 
306 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00890  palmitoyl-protein thioesterase, putative  30.25 
 
 
328 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00000429071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  29.31 
 
 
784 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
330 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  28.18 
 
 
364 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>