40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0514 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  100 
 
 
474 aa  969    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  52.72 
 
 
488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  51.77 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  45.82 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  35.66 
 
 
399 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  35.24 
 
 
414 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  34.83 
 
 
399 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  34.28 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  32.19 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  30.2 
 
 
449 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  31.68 
 
 
387 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  31.06 
 
 
396 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  30.87 
 
 
407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  30.97 
 
 
413 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  30.97 
 
 
413 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  30.49 
 
 
418 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  31.2 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  28.48 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  29.04 
 
 
304 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  32.97 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  28.65 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  35 
 
 
203 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  35 
 
 
203 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.6 
 
 
254 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  26.98 
 
 
254 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06702  GPI inositol-deacylase (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AYC8]  41.38 
 
 
1319 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0663088  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  23.71 
 
 
361 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  29.45 
 
 
1257 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  36.76 
 
 
286 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  52.08 
 
 
589 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  30.16 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.15 
 
 
217 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  47.92 
 
 
303 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  45.1 
 
 
211 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  45.1 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  47.92 
 
 
303 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  31.25 
 
 
197 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  30.67 
 
 
197 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  32.43 
 
 
547 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  43.75 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>