111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2289 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  52.85 
 
 
281 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  54.01 
 
 
282 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  51.82 
 
 
282 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  49.8 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  52.48 
 
 
311 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  49.8 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  48.96 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  50.41 
 
 
302 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  44.77 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  42.36 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  42.35 
 
 
573 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  41.67 
 
 
314 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  36.54 
 
 
304 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  42.54 
 
 
276 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  41.99 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.95 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  36.18 
 
 
280 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  31.34 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  35.68 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  36.98 
 
 
225 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  47.2 
 
 
257 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  38.41 
 
 
217 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  32.09 
 
 
222 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  32.9 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  35.98 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  34.54 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.8 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  33.19 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.16 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  36.11 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.97 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  31.53 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  35.05 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  35.53 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.54 
 
 
195 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.54 
 
 
195 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  33.03 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  30 
 
 
216 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  34.52 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  23.98 
 
 
206 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  26.21 
 
 
194 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.07 
 
 
356 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  31.97 
 
 
299 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  25.53 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0661  hypothetical protein  29.93 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  26.61 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  25.99 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  29.75 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  28.92 
 
 
450 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  32.99 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  32.99 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  32.99 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  32.99 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  21.55 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  32.99 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  32.99 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  32.99 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  32.99 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  29.89 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  31.53 
 
 
2169 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
365 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  35.11 
 
 
332 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  35.11 
 
 
332 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  31.62 
 
 
364 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  32.99 
 
 
364 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  33.67 
 
 
367 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  27.59 
 
 
344 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  32.99 
 
 
341 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  32.99 
 
 
360 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  32.99 
 
 
360 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  29.14 
 
 
457 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  25 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  33.01 
 
 
364 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.63 
 
 
430 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  29.35 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  24.72 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  26.79 
 
 
547 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  27.51 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.58 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  34.02 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  34.02 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.71 
 
 
562 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  24.31 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  33.01 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  34.02 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  33.01 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  36.26 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  22.16 
 
 
203 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  33.71 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.65 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  25.13 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  25.1 
 
 
361 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  30.77 
 
 
382 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.92 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>