40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4601 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  631  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  37.68 
 
 		 573 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  38.11 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  38.41 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  37.31 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  37.96 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  36.86 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  37.01 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  38.96 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  35.4 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  35.38 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  36.54 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  33.97 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  33.07 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  30.93 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  32.28 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.29 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  35.76 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.24 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  30.2 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  32.17 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  27.75 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  33.58 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  32 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.29 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  31.82 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  28.44 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  26.52 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28.67 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.42 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.67 
 
 		 222 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.67 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  27.16 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  25.84 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  32.17 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  25.37 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  35.37 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>