59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0582 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  36.21 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  36.27 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  35.57 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  33.83 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  34.94 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  35.08 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  34.68 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  32.96 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  32.92 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  33.19 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  33.33 
 
 		 573 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.65 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  40.46 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  30.8 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  30.93 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.87 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.8 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  27.78 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  29.82 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  26.07 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.86 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  28.69 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  29.58 
 
 		 2169 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30.43 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  26.29 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  25 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 474 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  25.9 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  30.67 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  31.36 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.22 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  30.89 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  25.89 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.09 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 403 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.82 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  29.75 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 365 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  23.98 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  30.51 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  30.08 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  30.08 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  30.08 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  30.08 
 
 		 364 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  25.46 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>