51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2739 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 363 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  31.93 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1533  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.62 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 302 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1921  Alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  hitchhiker  0.00212395 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34884  predicted protein  26.32 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.435198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2172  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  31.08 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  28.79 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.58 
 
 		 518 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 267 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  24.81 
 
 		 2762 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02911  hydrolase  36.92 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  31.9 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0460  proline iminopeptidase  29.41 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  33.58 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  22.59 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  39.36 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  30.56 
 
 		 272 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.65 
 
 		 276 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 284 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 289 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>