More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2686 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
310 aa  607  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
306 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
324 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.59 
 
 
330 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
297 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  29.45 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  34.33 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
323 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  38.62 
 
 
290 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
312 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
282 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
408 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
408 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
408 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  27.34 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  35.84 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.08 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.69 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.72 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.83 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.74 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.03 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.57 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.03 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.48 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  35.29 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.24 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.87 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.19 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.88 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.32 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.83 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.09 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.17 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
370 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
284 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
265 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
372 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  41.44 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.18 
 
 
371 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.12 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.59 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.63 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.59 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
277 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.03 
 
 
437 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.34 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  30.83 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  35.59 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
278 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.46 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>