22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1781 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 403 aa  828    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  36.15 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.15 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  39.39 
 
 		 281 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.47 
 
 		 342 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  42.25 
 
 		 223 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  33.94 
 
 		 222 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  30.47 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  30.47 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  35.37 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  30.83 
 
 		 282 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  32.28 
 
 		 309 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  34.19 
 
 		 339 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  29.06 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  28.88 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.97 
 
 		 1152 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  42.42 
 
 		 2169 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  32.79 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1152 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  32.48 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>