93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2233 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  100 
 
 		 338 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  93.2 
 
 		 338 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  70.69 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  48.18 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  47.04 
 
 		 324 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  39.12 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  40.6 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  39.59 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  41.15 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  37.92 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  37.8 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  37.4 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  36.67 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.67 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.64 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  33.55 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.59 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.14 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  27.23 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  32.28 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  28.95 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.05 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  31.13 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  30.54 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.66 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  23.98 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  30.34 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.76 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  26.77 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24.1 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.1 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  27.51 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  25.39 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  26.04 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  29.81 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.29 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  29.35 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  33.96 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  33.96 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  28.7 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  24.21 
 
 		 191 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  25.52 
 
 		 192 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  22.16 
 
 		 203 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  34.75 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.3 
 
 		 209 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  29.81 
 
 		 245 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  28.57 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  29.17 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  24.77 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  37.33 
 
 		 683 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.5 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  28.09 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  22.15 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  30.48 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.24 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  28.22 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  31.3 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  33.72 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1460 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  30.34 
 
 		 524 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  24.48 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1995  PGAP1 family protein  27.05 
 
 		 536 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0402712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  34.12 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  28.26 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  56.52 
 
 		 589 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  28.48 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  34.15 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  26.23 
 
 		 533 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  22.27 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  27.62 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  27.05 
 
 		 533 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  30.39 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  23.74 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1152 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  35.06 
 
 		 743 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  20.3 
 
 		 222 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.92 
 
 		 205 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  48.84 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>