67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4194 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  100 
 
 
430 aa  822    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  62.84 
 
 
303 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  62.5 
 
 
303 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  51.01 
 
 
302 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  49.5 
 
 
304 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  44.1 
 
 
309 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  46.26 
 
 
332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  41.54 
 
 
327 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  38.98 
 
 
338 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  42.11 
 
 
339 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  39.59 
 
 
338 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.47 
 
 
324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  36.36 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.86 
 
 
294 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  35.48 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  32.16 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.48 
 
 
276 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.47 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  28.74 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.44 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.5 
 
 
225 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  25.67 
 
 
222 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  30.68 
 
 
217 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.55 
 
 
223 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  32.99 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  37.09 
 
 
299 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.37 
 
 
211 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  27.07 
 
 
222 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  29.18 
 
 
311 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  27.08 
 
 
302 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.32 
 
 
222 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  28.95 
 
 
192 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  31.73 
 
 
261 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  33.33 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
403 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  29.03 
 
 
286 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  30.96 
 
 
282 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  30.37 
 
 
195 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  30.37 
 
 
195 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  25.77 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  27.35 
 
 
282 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.02 
 
 
191 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.48 
 
 
284 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  38.16 
 
 
256 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  32.14 
 
 
276 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  31 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  27.55 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.05 
 
 
269 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  33.33 
 
 
293 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  30.26 
 
 
252 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  33.02 
 
 
245 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  34.94 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  30.26 
 
 
252 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  32.89 
 
 
256 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  24.55 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  33.61 
 
 
357 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
292 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  34.25 
 
 
259 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  28.47 
 
 
255 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  34.06 
 
 
287 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  27.06 
 
 
278 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  21.89 
 
 
197 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  26.19 
 
 
203 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  32.46 
 
 
216 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  27.73 
 
 
256 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  27.86 
 
 
249 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>