147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6471 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  63.45 
 
 		 217 aa  268  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  59.7 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  52.25 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  51.8 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  42.99 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  36.32 
 
 		 281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  36.41 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  39.33 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  34.54 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  32.54 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  32.16 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  31.5 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.61 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.78 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  31.66 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.57 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.62 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  30.53 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.44 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  27.12 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  29.89 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  29.89 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  25.14 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  29.25 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  30.11 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.44 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  29.1 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  29.83 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.81 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  28.65 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  28.09 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  26.88 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  28.82 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.94 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  33.33 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  27.12 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  29.52 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  28.25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.76 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  27.39 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  28.5 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  27.38 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.64 
 
 		 430 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  28.47 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  38.94 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  29.25 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  32.86 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  24.86 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  24.86 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  28.07 
 
 		 454 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  24.89 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  31.91 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  33.61 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  36.13 
 
 		 473 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  31.82 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  21.47 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  32.79 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 		 475 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  23.87 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  23.44 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  25.25 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  29.17 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  32.37 
 
 		 364 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  31.36 
 
 		 364 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.83 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  21.18 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  31.36 
 
 		 341 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  31.36 
 
 		 364 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  25.95 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.83 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  31.36 
 
 		 360 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  31.36 
 
 		 360 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  36.46 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  36.46 
 
 		 367 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  36.46 
 
 		 367 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  36.56 
 
 		 367 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  18.04 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  26.04 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  27.52 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  36.71 
 
 		 2169 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 		 364 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 		 364 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  26.75 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  30.33 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 		 364 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  32.26 
 
 		 364 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  23.59 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.18 
 
 		 334 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 403 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  25.47 
 
 		 313 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  35.42 
 
 		 367 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  35.42 
 
 		 367 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  35.42 
 
 		 367 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  35.42 
 
 		 367 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>