43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11350 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  100 
 
 
313 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.59 
 
 
294 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  27.96 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  28.12 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  28.12 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  24.39 
 
 
222 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.58 
 
 
222 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.57 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.57 
 
 
338 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  31.07 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  32.35 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.47 
 
 
223 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.55 
 
 
430 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  36.11 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.87 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  38.71 
 
 
2169 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  29.46 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  30.69 
 
 
276 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  27.27 
 
 
312 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  29.93 
 
 
342 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.71 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.38 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  24.88 
 
 
448 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  31.63 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  25.16 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.22 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  20.78 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2478  PGAP1 family protein  25.57 
 
 
465 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  23.94 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  27.87 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2232  hypothetical protein  25 
 
 
467 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000103157  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  23.08 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  20.64 
 
 
407 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  41.67 
 
 
589 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  32.84 
 
 
743 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.74 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.03 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  24.66 
 
 
457 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  23.04 
 
 
413 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  23.04 
 
 
413 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  40 
 
 
2159 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>