78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4259 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  69.47 
 
 		 192 aa  274  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  63.35 
 
 		 191 aa  255  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  59.89 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  33.85 
 
 		 211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  37.79 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  37.21 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  33.33 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  33.33 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  37.58 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  37.06 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  30.89 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  36.36 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  28.95 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32 
 
 		 298 aa  94.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  30.29 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  30.06 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  32.91 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  27.27 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  32.47 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  32.47 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  31.68 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  32.69 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  30.77 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  30.13 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  30.13 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.95 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.47 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.98 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.37 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  30.91 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  26.98 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  33.09 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.03 
 
 		 332 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  23.66 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  30.25 
 
 		 309 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.63 
 
 		 382 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  23.57 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.04 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.74 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  26.13 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  24.53 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  28.95 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  25 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  26.39 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.02 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  28.4 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.79 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  26.04 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.47 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  25.52 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  26.7 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  27.68 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  32.35 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.48 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  31.86 
 
 		 302 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  24.64 
 
 		 311 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  29.14 
 
 		 344 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  25.71 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  34.07 
 
 		 357 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  23.29 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  23.7 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  55.81 
 
 		 487 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.35 
 
 		 286 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  53.49 
 
 		 488 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  26.92 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  48.89 
 
 		 589 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  28.41 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.3 
 
 		 273 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  29.03 
 
 		 364 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  25.37 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  42.11 
 
 		 387 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 289 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  24.54 
 
 		 293 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  33.73 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  29.13 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>