17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1297 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 
246 aa  474  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  56.44 
 
 
261 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3706  putative lipase transmembrane protein  58.69 
 
 
248 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  42.79 
 
 
238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  49.77 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3174  putative lipase transmembrane protein  45.04 
 
 
251 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725914  normal  0.0262248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  35.38 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  31.86 
 
 
338 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.98 
 
 
324 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  31.37 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  23.96 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  23.96 
 
 
195 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  27.23 
 
 
191 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  32.14 
 
 
294 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  35.07 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  25.76 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  48.84 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>