19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3706 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3706  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 		 248 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  57.52 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  48.15 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  46.43 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  36.32 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3174  putative lipase transmembrane protein  42.23 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725914  normal  0.0262248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  32.12 
 
 		 357 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  32.39 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  30.97 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  35.71 
 
 		 876 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  35.71 
 
 		 876 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.6 
 
 		 313 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.46 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 257 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>