172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1591 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.91 
 
 
324 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  34.18 
 
 
339 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  31.62 
 
 
338 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.67 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  33.85 
 
 
327 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  32.92 
 
 
344 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  31.72 
 
 
276 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  30.8 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  29.34 
 
 
302 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  34.84 
 
 
334 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  30.22 
 
 
304 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  37.31 
 
 
361 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.45 
 
 
286 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  31.56 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  30.18 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  31.56 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.65 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.62 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  31.6 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.8 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.19 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.76 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.65 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  29.08 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  28.18 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  29.47 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.83 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  30.64 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.19 
 
 
191 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  29.28 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  30.1 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  26.88 
 
 
223 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.67 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  30.89 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  27.27 
 
 
192 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.39 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.87 
 
 
200 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.87 
 
 
200 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.87 
 
 
195 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.3 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  27.65 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  23.38 
 
 
203 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  40.17 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  35.25 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  24.62 
 
 
203 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  28.08 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  35.9 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  29.59 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  34.43 
 
 
364 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  24.32 
 
 
222 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.66 
 
 
281 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  27.89 
 
 
238 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  29.29 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  40.18 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  33.61 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  40.18 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  24.43 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  33.61 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  42.59 
 
 
432 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  34.17 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.15 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  34.17 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  26.78 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  49.25 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  34.17 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  34.17 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  33.33 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  23.59 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  35.78 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  34.17 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  28.57 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  34.82 
 
 
364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  34.82 
 
 
364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  34.82 
 
 
364 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  30.37 
 
 
547 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  29.7 
 
 
475 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  24.1 
 
 
254 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  30.97 
 
 
299 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  32.26 
 
 
533 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  25.53 
 
 
283 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  28.67 
 
 
533 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1955  hypothetical protein  32.26 
 
 
533 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  32.26 
 
 
533 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  28.3 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  32.26 
 
 
533 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  32.26 
 
 
533 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  32.14 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  32.12 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>