33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2847 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  43.78 
 
 
261 aa  185  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  42.79 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  41.7 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3706  putative lipase transmembrane protein  36.32 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3174  putative lipase transmembrane protein  38.24 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725914  normal  0.0262248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  28.72 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.76 
 
 
338 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  29.41 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  28.42 
 
 
339 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  33.33 
 
 
342 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  27.89 
 
 
294 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  21.81 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  22.05 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  22.68 
 
 
195 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  22.68 
 
 
195 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  24.34 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  24.1 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  26.7 
 
 
304 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  25.74 
 
 
357 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  24.87 
 
 
211 aa  45.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.33 
 
 
324 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.44 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  25.58 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  29.1 
 
 
365 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  22.93 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  27.84 
 
 
361 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  25.13 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  21.58 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  29.27 
 
 
332 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  25 
 
 
430 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.07 
 
 
286 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  24.04 
 
 
282 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>