99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0435 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  76.41 
 
 
304 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  53.51 
 
 
303 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  51.54 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  53.18 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  51.01 
 
 
430 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  46.97 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  44.1 
 
 
327 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  45.61 
 
 
338 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  44.05 
 
 
338 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  36.3 
 
 
344 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  41.67 
 
 
339 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  34.33 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.34 
 
 
294 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.17 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.15 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.6 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.4 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.09 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  30.68 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  29.61 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  27.17 
 
 
222 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.38 
 
 
225 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.25 
 
 
223 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.38 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.7 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  24.08 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.56 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  26.82 
 
 
222 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  29.9 
 
 
282 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  27.37 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.13 
 
 
206 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  26.02 
 
 
194 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.77 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.8 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  28.9 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  25.68 
 
 
191 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.84 
 
 
192 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  31.16 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  37.07 
 
 
357 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 
475 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24.39 
 
 
195 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.78 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.74 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 
457 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.39 
 
 
195 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  28.88 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  24.19 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  21.72 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25.69 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  31.73 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  34.38 
 
 
772 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  27.15 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  32.11 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  33.7 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.6 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.6 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  25.44 
 
 
197 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  26.01 
 
 
454 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 
1411 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  28.24 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  34.65 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  26.54 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  26.46 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  25.65 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  30.96 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  27.93 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  39.47 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  34.51 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  32.18 
 
 
743 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.57 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  25.2 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  34.51 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  23.08 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  25 
 
 
195 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  27.98 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  25.13 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  21.74 
 
 
197 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  25.13 
 
 
238 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  35.2 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  36.56 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  34.48 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  31.09 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  34.96 
 
 
364 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  26.28 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  38.67 
 
 
264 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  27.16 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  34.21 
 
 
264 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  31.5 
 
 
414 aa  42.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  34.96 
 
 
364 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  24.6 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  34.96 
 
 
364 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>