85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4221 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 		 304 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  76.41 
 
 		 302 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  52.68 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  49.34 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  49.34 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  49.5 
 
 		 430 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  44.49 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  37.77 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  41.15 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  40.5 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  39.22 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  36.97 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  35.84 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.22 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.89 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.63 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.65 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.82 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  29.67 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  35.03 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  31.07 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  32.42 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.61 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  28.33 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  26.74 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.12 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  36.52 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.92 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  32.18 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.18 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  26.97 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  26.13 
 
 		 194 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.65 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.72 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  35.45 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  24.24 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25.83 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  29.11 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  33 
 
 		 743 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  25.39 
 
 		 192 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.71 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  22.84 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  36.52 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  37.17 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  27.69 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  37.17 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  37.17 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.53 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  25.93 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.53 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  32.35 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.83 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.67 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  23.62 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  33.64 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  23.17 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  23.81 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  29.14 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  26.7 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.12 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  23.17 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  27.12 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  26.61 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  25.58 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.57 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.95 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  25 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  31.88 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  27.03 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.11 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  31.96 
 
 		 772 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  25.56 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  28.76 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  22.7 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.57 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  32.46 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4872  hypothetical protein  31 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0644082  normal  0.0526328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  44.9 
 
 		 487 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  28.68 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  32.63 
 
 		 353 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>