138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1184 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
286 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  32.21 
 
 
299 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.83 
 
 
273 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  35.23 
 
 
357 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  32.59 
 
 
561 aa  95.9  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  31.16 
 
 
394 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  27.9 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  28.36 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  28.96 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  27.06 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  27.59 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  29.64 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  26.82 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  27.24 
 
 
360 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  27.24 
 
 
360 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  27.24 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  27.05 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  27.05 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  27.05 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  25.49 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  28 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  26.67 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  36.59 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  36.59 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  36.59 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  36.59 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  38.79 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  25.68 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  24.2 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  26.24 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  23.84 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  35.77 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  35.77 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  35.77 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  27.34 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02710  lipase 2, putative  28.98 
 
 
587 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  25 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  37.07 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  29.48 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
351 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78871  predicted protein  38.79 
 
 
114 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  26.54 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.8 
 
 
203 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  32 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  32.5 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  29.17 
 
 
197 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  28.95 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.69 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  22.73 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  26.54 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  25.1 
 
 
353 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  42.65 
 
 
356 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.7 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.09 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  31.15 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  29.73 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  30.83 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  34.15 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.78 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  26.4 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  33.07 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  35.09 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  28 
 
 
203 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  24.74 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.05 
 
 
222 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  27.93 
 
 
222 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  24.74 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.95 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1955  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  32.46 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  35.85 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1995  PGAP1 family protein  27.27 
 
 
536 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0402712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  27.73 
 
 
533 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  35.95 
 
 
338 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  28.32 
 
 
222 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  26.89 
 
 
533 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  26.89 
 
 
533 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  30.65 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.19 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  36.24 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.92 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  26.2 
 
 
2169 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>