127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4284 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  100 
 
 
2169 aa  4367    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  34.29 
 
 
998 aa  101  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  39.11 
 
 
3197 aa  89  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.89 
 
 
3197 aa  86.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  29.39 
 
 
991 aa  75.5  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.28 
 
 
1109 aa  73.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  28.06 
 
 
6276 aa  72.4  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.37 
 
 
1565 aa  71.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  25.69 
 
 
1779 aa  69.7  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  36.67 
 
 
384 aa  68.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  28.25 
 
 
833 aa  65.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.96 
 
 
816 aa  65.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.17 
 
 
217 aa  63.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  39.8 
 
 
1512 aa  63.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  26.92 
 
 
393 aa  63.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  38.38 
 
 
1193 aa  62.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  30.77 
 
 
286 aa  60.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  28.45 
 
 
1916 aa  60.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  28.42 
 
 
792 aa  59.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  40.43 
 
 
1416 aa  59.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.1 
 
 
225 aa  59.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.18 
 
 
1212 aa  59.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  32.03 
 
 
554 aa  58.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  29.56 
 
 
2820 aa  57  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  22.75 
 
 
965 aa  56.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  29.58 
 
 
283 aa  55.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  33.08 
 
 
302 aa  55.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  27.84 
 
 
623 aa  55.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  22.46 
 
 
965 aa  55.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  35.24 
 
 
311 aa  55.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  22.46 
 
 
965 aa  55.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  30.73 
 
 
260 aa  55.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  35.48 
 
 
393 aa  55.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  22.54 
 
 
965 aa  55.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  34.58 
 
 
283 aa  54.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  22.41 
 
 
965 aa  54.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  33.1 
 
 
677 aa  53.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  26.95 
 
 
222 aa  52.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.34 
 
 
1001 aa  52.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  21.96 
 
 
965 aa  52  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.49 
 
 
11716 aa  52.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  23.14 
 
 
965 aa  52.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.13 
 
 
280 aa  52  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  32.82 
 
 
1150 aa  52  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  28.93 
 
 
282 aa  51.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.03 
 
 
1862 aa  51.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.15 
 
 
275 aa  51.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  32.08 
 
 
282 aa  51.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  30.83 
 
 
281 aa  51.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  36.48 
 
 
2066 aa  51.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  35.16 
 
 
281 aa  51.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  36.71 
 
 
223 aa  51.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.75 
 
 
276 aa  51.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2200  hypothetical protein  42.86 
 
 
454 aa  51.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  38.2 
 
 
607 aa  50.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  21.58 
 
 
965 aa  50.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  36.51 
 
 
386 aa  50.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  41.07 
 
 
326 aa  50.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  23.14 
 
 
965 aa  50.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  31.28 
 
 
734 aa  50.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  28.73 
 
 
1057 aa  50.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.36 
 
 
2839 aa  50.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  32.1 
 
 
1736 aa  50.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  34.71 
 
 
1303 aa  49.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.19 
 
 
293 aa  49.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1868  hypothetical protein  29.7 
 
 
312 aa  49.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  40.14 
 
 
869 aa  49.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  30.77 
 
 
312 aa  49.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  29.29 
 
 
917 aa  49.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  26.48 
 
 
941 aa  48.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  27.27 
 
 
777 aa  48.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  26.62 
 
 
1025 aa  48.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
365 aa  48.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.92 
 
 
1073 aa  49.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  22.31 
 
 
965 aa  49.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3972  PKD domain-containing protein  28.89 
 
 
993 aa  47.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  34.81 
 
 
426 aa  48.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  27.66 
 
 
341 aa  48.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  27.87 
 
 
344 aa  48.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  34.65 
 
 
1879 aa  48.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  22.32 
 
 
1162 aa  48.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  24.71 
 
 
1606 aa  48.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.48 
 
 
752 aa  47.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  27.66 
 
 
364 aa  47.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  27.66 
 
 
364 aa  47.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  27.91 
 
 
367 aa  47.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  34.43 
 
 
338 aa  47.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  31.53 
 
 
286 aa  47.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  36.08 
 
 
699 aa  47.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  27.66 
 
 
360 aa  47.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  27.66 
 
 
360 aa  47.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  25.6 
 
 
489 aa  47.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1333  hypothetical protein  39.29 
 
 
302 aa  47.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  24.54 
 
 
1027 aa  47.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  38.71 
 
 
313 aa  47.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.2 
 
 
286 aa  47.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.12 
 
 
929 aa  47.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  27.15 
 
 
349 aa  47  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  32.39 
 
 
414 aa  47  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  26.49 
 
 
516 aa  47  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>