More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3605 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  76.54 
 
 		 540 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 		 792 aa  1598    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  74.06 
 
 		 539 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  72.01 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  67.41 
 
 		 662 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  69.92 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  69.54 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  66.49 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  69.54 
 
 		 532 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  52.79 
 
 		 521 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  38.48 
 
 		 703 aa  352  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  37.95 
 
 		 652 aa  244  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  39.16 
 
 		 430 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  37.15 
 
 		 1271 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  33.54 
 
 		 762 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  32.41 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  35.5 
 
 		 400 aa  197  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  31.55 
 
 		 854 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  34.68 
 
 		 425 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  34.25 
 
 		 455 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  32.83 
 
 		 439 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  32.5 
 
 		 414 aa  184  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.13 
 
 		 869 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.09 
 
 		 674 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.86 
 
 		 674 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.55 
 
 		 674 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.08 
 
 		 674 aa  180  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.08 
 
 		 674 aa  180  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.86 
 
 		 674 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  34.71 
 
 		 868 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.08 
 
 		 674 aa  180  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.04 
 
 		 867 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.31 
 
 		 848 aa  178  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.39 
 
 		 855 aa  177  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 674 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 		 868 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 674 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.85 
 
 		 674 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  35.08 
 
 		 398 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 		 868 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.08 
 
 		 674 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  33.74 
 
 		 868 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  31.81 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  31.33 
 
 		 868 aa  170  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  32.19 
 
 		 451 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  33.41 
 
 		 868 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  30.33 
 
 		 848 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 863 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  31.33 
 
 		 563 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  27.36 
 
 		 639 aa  160  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  34.04 
 
 		 482 aa  160  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.54 
 
 		 1565 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 652 aa  155  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.14 
 
 		 972 aa  151  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.64 
 
 		 675 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  31.49 
 
 		 586 aa  150  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 		 634 aa  147  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  40.98 
 
 		 623 aa  146  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.71 
 
 		 816 aa  146  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 1129 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 1127 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1080 aa  145  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  31.81 
 
 		 431 aa  144  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.87 
 
 		 657 aa  144  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  37.55 
 
 		 1057 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 1127 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.2 
 
 		 1127 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.86 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  28.08 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  44.25 
 
 		 1150 aa  134  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  29.49 
 
 		 396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.6 
 
 		 699 aa  131  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.73 
 
 		 505 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.89 
 
 		 373 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.9 
 
 		 372 aa  128  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  34.59 
 
 		 823 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 1578 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  40.72 
 
 		 873 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  25.39 
 
 		 1051 aa  124  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.16 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.55 
 
 		 1362 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.2 
 
 		 1094 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.69 
 
 		 561 aa  118  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.51 
 
 		 752 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  31.56 
 
 		 734 aa  115  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.16 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1667 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.68 
 
 		 1146 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  30.94 
 
 		 1300 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41.48 
 
 		 2066 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.38 
 
 		 679 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.64 
 
 		 3197 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  27.86 
 
 		 859 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  29.84 
 
 		 2036 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  42.94 
 
 		 1027 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1682 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  31.29 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.27 
 
 		 407 aa  108  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>