267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000945 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  49.3 
 
 
868 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 
863 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  49.65 
 
 
868 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  76.56 
 
 
848 aa  1332    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  49.36 
 
 
869 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  100 
 
 
848 aa  1734    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  48.01 
 
 
868 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  47.07 
 
 
868 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  45.73 
 
 
972 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  91.86 
 
 
855 aa  1584    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  48.33 
 
 
868 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  49.82 
 
 
867 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  49.3 
 
 
868 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  51.01 
 
 
563 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  45.09 
 
 
1271 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  33.56 
 
 
431 aa  243  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.55 
 
 
674 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.55 
 
 
674 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  32.25 
 
 
674 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.33 
 
 
674 aa  221  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.33 
 
 
674 aa  221  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.33 
 
 
674 aa  221  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.33 
 
 
674 aa  221  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.33 
 
 
674 aa  220  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
674 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.69 
 
 
674 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.69 
 
 
674 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  31.27 
 
 
703 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  32.6 
 
 
652 aa  194  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.73 
 
 
861 aa  184  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.83 
 
 
1080 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.81 
 
 
792 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  30.21 
 
 
482 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.05 
 
 
639 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 
484 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  33.19 
 
 
532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  29.79 
 
 
521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  28.78 
 
 
398 aa  161  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  30.77 
 
 
539 aa  160  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
652 aa  160  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  29.38 
 
 
540 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.14 
 
 
505 aa  158  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  30.36 
 
 
430 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.5 
 
 
651 aa  157  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  29.5 
 
 
762 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  34.32 
 
 
373 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  29.89 
 
 
542 aa  155  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  27.86 
 
 
699 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  27.29 
 
 
699 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  29.78 
 
 
854 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  32.39 
 
 
377 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  26.79 
 
 
699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  26.62 
 
 
699 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 
904 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  29.91 
 
 
662 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  29.02 
 
 
536 aa  147  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  26.62 
 
 
699 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
540 aa  146  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  26.67 
 
 
451 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  28.41 
 
 
414 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  27.51 
 
 
1146 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  24.03 
 
 
855 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.19 
 
 
388 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.72 
 
 
1127 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  27.72 
 
 
1127 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 
364 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  27.79 
 
 
559 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  28.54 
 
 
425 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 
1127 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  26.96 
 
 
997 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 
1127 aa  134  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.45 
 
 
401 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.13 
 
 
675 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  29.61 
 
 
372 aa  129  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  27.49 
 
 
400 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  26.8 
 
 
439 aa  128  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  26.95 
 
 
463 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27.52 
 
 
1051 aa  127  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.14 
 
 
499 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.19 
 
 
382 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  31.25 
 
 
985 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  39.22 
 
 
1057 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  29.4 
 
 
586 aa  124  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 
1129 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
1578 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.58 
 
 
455 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
355 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  28.76 
 
 
763 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.62 
 
 
657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  27.2 
 
 
1054 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  27.16 
 
 
1053 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  23.98 
 
 
760 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  27.92 
 
 
396 aa  114  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
1782 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 
472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  25.36 
 
 
772 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  24.61 
 
 
634 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.34 
 
 
407 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
465 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.92 
 
 
816 aa  107  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>