More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2921 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  100 
 
 
623 aa  1240    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  61.81 
 
 
816 aa  289  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  59.92 
 
 
634 aa  272  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  38.74 
 
 
521 aa  261  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  60.89 
 
 
1057 aa  253  6e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  38.33 
 
 
481 aa  197  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  37.87 
 
 
461 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  43.88 
 
 
563 aa  191  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  36.75 
 
 
1194 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  39.53 
 
 
507 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  37.58 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  36.04 
 
 
751 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  37.77 
 
 
451 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  37.46 
 
 
451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  36.62 
 
 
451 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  36.05 
 
 
451 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  35.31 
 
 
451 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  35.31 
 
 
451 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.05 
 
 
490 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 
504 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  35.58 
 
 
401 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  32.56 
 
 
562 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  53.18 
 
 
1565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  54.24 
 
 
1150 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
453 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
453 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
453 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
453 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  36.29 
 
 
315 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
453 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
449 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
453 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  32.23 
 
 
597 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  35.74 
 
 
358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  32.06 
 
 
2305 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  32.38 
 
 
393 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  32.9 
 
 
537 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  30.94 
 
 
593 aa  139  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  30.57 
 
 
665 aa  136  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  40.57 
 
 
657 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  53.45 
 
 
734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.9 
 
 
2310 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  32.31 
 
 
324 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  36.29 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  38.62 
 
 
792 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  35.07 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  33.23 
 
 
897 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  33.23 
 
 
897 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  28.72 
 
 
548 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  30.22 
 
 
324 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  33.23 
 
 
897 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  33.87 
 
 
686 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  33.87 
 
 
686 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  30.58 
 
 
324 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  28.36 
 
 
561 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  44.51 
 
 
1916 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  30.97 
 
 
465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  29.94 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  29.27 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  30.41 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  28.72 
 
 
338 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  30.14 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  42.94 
 
 
873 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  45.99 
 
 
2066 aa  111  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  32.01 
 
 
543 aa  107  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.91 
 
 
1027 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  38.73 
 
 
517 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  38.2 
 
 
1556 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.99 
 
 
526 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.19 
 
 
639 aa  99.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  39.05 
 
 
1667 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.98 
 
 
2176 aa  98.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  37.79 
 
 
1094 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.63 
 
 
675 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  43.56 
 
 
3197 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.65 
 
 
658 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  39.6 
 
 
552 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  35.98 
 
 
859 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.5 
 
 
752 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.13 
 
 
944 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  39.66 
 
 
918 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  38.89 
 
 
669 aa  94.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  26.32 
 
 
421 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.09 
 
 
581 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  42.94 
 
 
3197 aa  94  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  38.51 
 
 
944 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  38.51 
 
 
944 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.59 
 
 
679 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  38.51 
 
 
944 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.9 
 
 
910 aa  93.6  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  33.99 
 
 
561 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  34.39 
 
 
820 aa  92  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  38.17 
 
 
1771 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.87 
 
 
3295 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.51 
 
 
944 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  37.2 
 
 
713 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  36.42 
 
 
685 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.47 
 
 
2554 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.04 
 
 
773 aa  90.9  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  26.59 
 
 
591 aa  89.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>