65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03189 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  91.42 
 
 		 897 aa  1263    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  91.12 
 
 		 897 aa  1261    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  91.42 
 
 		 897 aa  1265    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  100 
 
 		 686 aa  1423    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  100 
 
 		 686 aa  1423    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  39.94 
 
 		 504 aa  209  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  39.81 
 
 		 451 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  39.62 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  36.77 
 
 		 507 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 449 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 453 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 453 aa  200  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  39.5 
 
 		 451 aa  200  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 453 aa  200  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  39.5 
 
 		 451 aa  200  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 453 aa  200  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 453 aa  200  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  39.62 
 
 		 453 aa  200  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.91 
 
 		 2305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  36.94 
 
 		 451 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  37.74 
 
 		 562 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  36.62 
 
 		 451 aa  197  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  30.35 
 
 		 481 aa  190  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  37.91 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  36.16 
 
 		 401 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  35.74 
 
 		 1194 aa  183  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.5 
 
 		 2310 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  34.38 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  35.13 
 
 		 393 aa  160  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  35.18 
 
 		 358 aa  158  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  33.11 
 
 		 593 aa  156  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  32.59 
 
 		 665 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  35.71 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  32.3 
 
 		 597 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.08 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  31.56 
 
 		 324 aa  134  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  31.56 
 
 		 324 aa  134  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  32.9 
 
 		 426 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  32.26 
 
 		 452 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  27.94 
 
 		 751 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  26.77 
 
 		 623 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  32.23 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  32.14 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  27.56 
 
 		 548 aa  111  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  29.75 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  30.55 
 
 		 324 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  27.53 
 
 		 461 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  25.16 
 
 		 521 aa  94.7  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  26.76 
 
 		 492 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  91.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  27.78 
 
 		 358 aa  90.5  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  25.73 
 
 		 514 aa  88.2  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  30 
 
 		 591 aa  87.4  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.04 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  25.16 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  24.18 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  25.45 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  25.97 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  27.94 
 
 		 365 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  62.5 
 
 		 1242 aa  47.4  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  62.5 
 
 		 1331 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.28 
 
 		 669 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  57.14 
 
 		 443 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>