63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2141 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  98.82 
 
 
593 aa  1206    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  100 
 
 
665 aa  1365    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  41.12 
 
 
324 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  40.81 
 
 
324 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  39.6 
 
 
539 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  38.24 
 
 
507 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  35.6 
 
 
401 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.01 
 
 
2305 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  34.48 
 
 
451 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  35.65 
 
 
504 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  35 
 
 
481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  35.14 
 
 
451 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  34.48 
 
 
451 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  34.48 
 
 
451 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  34.17 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  35.11 
 
 
451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  36.12 
 
 
1194 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  36.33 
 
 
2310 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
453 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
449 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
453 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
453 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
453 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
453 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  34.73 
 
 
453 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  32.59 
 
 
686 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  32.59 
 
 
686 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  32.59 
 
 
897 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  32.59 
 
 
897 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  32.59 
 
 
897 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  35.34 
 
 
426 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  32.76 
 
 
751 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  37.02 
 
 
562 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  33.45 
 
 
358 aa  137  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  30.57 
 
 
623 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  31.05 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  32.03 
 
 
537 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  33.88 
 
 
315 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  32.14 
 
 
543 aa  126  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  32.61 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  30.38 
 
 
492 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  31.29 
 
 
393 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  31 
 
 
671 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.74 
 
 
452 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.46 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.68 
 
 
465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  30.2 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  30.48 
 
 
436 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  28.72 
 
 
561 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.25 
 
 
490 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  30.57 
 
 
421 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  30.5 
 
 
514 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  27.18 
 
 
552 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 
591 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  26.89 
 
 
338 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  29.85 
 
 
365 aa  97.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  28.44 
 
 
521 aa  95.9  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  25.84 
 
 
461 aa  93.6  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0039  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  27.24 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  26.39 
 
 
324 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  27.53 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  23.26 
 
 
782 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>