200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6988 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  100 
 
 
539 aa  1057    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  41.62 
 
 
507 aa  347  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  36.78 
 
 
562 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  43.08 
 
 
504 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  44.65 
 
 
451 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
453 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
449 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  43.59 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  44.65 
 
 
451 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  44.65 
 
 
451 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  44.16 
 
 
451 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  44.65 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  44.03 
 
 
451 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  42.76 
 
 
1194 aa  229  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  43.59 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  42.95 
 
 
2305 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  42.17 
 
 
537 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  39.56 
 
 
593 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  39.24 
 
 
665 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  40 
 
 
751 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  37.63 
 
 
393 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  44.11 
 
 
2310 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  37.91 
 
 
897 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  37.91 
 
 
897 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  37.91 
 
 
686 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  37.91 
 
 
686 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  37.55 
 
 
897 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.25 
 
 
623 aa  183  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  36.51 
 
 
324 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  36.51 
 
 
324 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  38.26 
 
 
358 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  42.91 
 
 
358 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  38.59 
 
 
481 aa  176  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  28.31 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  42.26 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  37.78 
 
 
540 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  41.76 
 
 
426 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  36.69 
 
 
597 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  37.35 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.59 
 
 
526 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  36.76 
 
 
465 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  35.69 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  34.5 
 
 
361 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  32.77 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  32.58 
 
 
543 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  30.17 
 
 
561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  31.19 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.54 
 
 
490 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  32.11 
 
 
421 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  28.48 
 
 
338 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  28.38 
 
 
552 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  31.09 
 
 
548 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  30.9 
 
 
671 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  31.96 
 
 
436 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  28.97 
 
 
461 aa  94.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  40.44 
 
 
467 aa  86.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  34.84 
 
 
613 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  28.77 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  41.24 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  41.24 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  28.39 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.74 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  35.2 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  35.56 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  37.01 
 
 
652 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  39.58 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  35.58 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.36 
 
 
880 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  36.36 
 
 
559 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  35.71 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  33.81 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  37.76 
 
 
934 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  33.33 
 
 
596 aa  67  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  36.56 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  39.18 
 
 
906 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  35.51 
 
 
539 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  36.89 
 
 
746 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 
966 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  38.54 
 
 
432 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  34.86 
 
 
438 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 
366 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  36.84 
 
 
690 aa  64.7  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.86 
 
 
466 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  33.58 
 
 
669 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  35.79 
 
 
854 aa  63.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  37.5 
 
 
489 aa  63.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 
540 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  35.79 
 
 
990 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  37.37 
 
 
580 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  33.66 
 
 
623 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  36.56 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 
963 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  29.29 
 
 
1055 aa  61.6  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  33.68 
 
 
646 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  35.42 
 
 
436 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>