175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1328 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  100 
 
 		 452 aa  914    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  57.18 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  65.58 
 
 		 315 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  87.1 
 
 		 732 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  80.49 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  77.69 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  40.31 
 
 		 597 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  71.07 
 
 		 1072 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  42.97 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  40 
 
 		 539 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  38.89 
 
 		 1194 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  67.52 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  35.2 
 
 		 507 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  34.29 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  59.38 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  58.2 
 
 		 634 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  35.21 
 
 		 562 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  36.76 
 
 		 751 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  37.75 
 
 		 623 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  32.17 
 
 		 686 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  32.17 
 
 		 686 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  32.17 
 
 		 897 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  32.17 
 
 		 897 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  32.17 
 
 		 897 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.53 
 
 		 2305 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  47.62 
 
 		 801 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  35.25 
 
 		 803 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  34.28 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  33.02 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  37.3 
 
 		 401 aa  128  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  34.02 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.99 
 
 		 933 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  33.65 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  32.09 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  32.09 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  52.89 
 
 		 890 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  30.54 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.2 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  33.74 
 
 		 665 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  33.74 
 
 		 593 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  32.05 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  29.48 
 
 		 552 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  34.63 
 
 		 324 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  49.18 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  28.52 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  29.8 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.01 
 
 		 2310 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  52.38 
 
 		 516 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  30.92 
 
 		 591 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.79 
 
 		 815 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.27 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  33.09 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  32.53 
 
 		 393 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  26.88 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.45 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  35.5 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  27.06 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.25 
 
 		 627 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  46.46 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  46.03 
 
 		 1128 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  29.17 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  32.33 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  36.69 
 
 		 1207 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  44.72 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  31.02 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  39.07 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  31.1 
 
 		 361 aa  99.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  27.8 
 
 		 548 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  39.73 
 
 		 801 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  46.02 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  39.5 
 
 		 496 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  31.17 
 
 		 543 aa  97.1  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  30.56 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 		 709 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  30.56 
 
 		 324 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  46.15 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  42.74 
 
 		 558 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  48.67 
 
 		 469 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  38.52 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  40.34 
 
 		 568 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.86 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  42.5 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.5 
 
 		 498 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  36.3 
 
 		 522 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  42.24 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.53 
 
 		 489 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  42.4 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  40.88 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  39.34 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  29.36 
 
 		 521 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>