114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1588 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  76.16 
 
 		 453 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  76.16 
 
 		 453 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  86.47 
 
 		 451 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  75.06 
 
 		 504 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  89.14 
 
 		 451 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  99.33 
 
 		 451 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  89.14 
 
 		 451 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  76.16 
 
 		 453 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  76.16 
 
 		 453 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  75.94 
 
 		 453 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  76.39 
 
 		 449 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  76.16 
 
 		 453 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  88.91 
 
 		 451 aa  821    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  100 
 
 		 451 aa  907    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  63.86 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  45.86 
 
 		 507 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  43.55 
 
 		 539 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  42.81 
 
 		 1194 aa  222  9e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  34.29 
 
 		 540 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  33.84 
 
 		 537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  39.58 
 
 		 562 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  37.74 
 
 		 686 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  37.74 
 
 		 686 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  37.74 
 
 		 897 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  37.74 
 
 		 897 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  37.74 
 
 		 897 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  33.48 
 
 		 543 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.2 
 
 		 2305 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  41.73 
 
 		 426 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  38.11 
 
 		 358 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  36.54 
 
 		 481 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  40.14 
 
 		 2310 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  36.86 
 
 		 393 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  34.48 
 
 		 593 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  34.17 
 
 		 665 aa  173  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  38.49 
 
 		 623 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  34.87 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  34.58 
 
 		 324 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  37.46 
 
 		 751 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.57 
 
 		 490 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  34.77 
 
 		 597 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  33.88 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  33.77 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.31 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  31.66 
 
 		 591 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  28.16 
 
 		 548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  32.27 
 
 		 552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  28.62 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  31.69 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  33.21 
 
 		 561 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  30.5 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  32.2 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 671 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  30.04 
 
 		 358 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  33.61 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  26.81 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  31.96 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  36.9 
 
 		 985 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.19 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  25.56 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  30.64 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  43.12 
 
 		 675 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  35.59 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  38.1 
 
 		 868 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  38.1 
 
 		 868 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.48 
 
 		 869 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.76 
 
 		 867 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  39.77 
 
 		 1577 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  36.9 
 
 		 868 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  35.64 
 
 		 868 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 868 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  39.56 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 868 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  37.93 
 
 		 1260 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  30.19 
 
 		 1242 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  34.62 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  53.66 
 
 		 855 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  30.36 
 
 		 657 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  45.31 
 
 		 848 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  36.84 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 		 1331 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  50 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  47.83 
 
 		 574 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  45.28 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  36.67 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  45.45 
 
 		 567 aa  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  62.86 
 
 		 1362 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  33.68 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1429  carbohydrate-binding family V/XII protein  71.43 
 
 		 29 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0994108  hitchhiker  0.000249983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  43.18 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  33.33 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  50 
 
 		 855 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  42.5 
 
 		 639 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  45.45 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  55.56 
 
 		 353 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.18 
 
 		 1057 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>