15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1429 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1429  carbohydrate-binding family V/XII protein  100 
 
 
29 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0994108  hitchhiker  0.000249983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  78.57 
 
 
504 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  78.57 
 
 
451 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  75 
 
 
451 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  75 
 
 
451 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  75 
 
 
451 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  71.43 
 
 
451 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
449 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  75 
 
 
453 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  71.43 
 
 
451 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>