141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3770 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 420 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  60.41 
 
 		 648 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  59.11 
 
 		 341 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  53.47 
 
 		 551 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  57 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  58.5 
 
 		 468 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  56.37 
 
 		 613 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  60.71 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  56.8 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  34.91 
 
 		 543 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.02 
 
 		 846 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  32.7 
 
 		 848 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  31.37 
 
 		 846 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  32.38 
 
 		 846 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  31.14 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  31.14 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  33.13 
 
 		 680 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  30.86 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  30.86 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  31.56 
 
 		 376 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  30.57 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  29.91 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  31.15 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  29.91 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.44 
 
 		 1362 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 1578 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.04 
 
 		 516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  28.05 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  27.89 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  30.13 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  28.06 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 727 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.87 
 
 		 729 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.87 
 
 		 729 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.71 
 
 		 803 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  28.06 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  29.75 
 
 		 782 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.13 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  28 
 
 		 565 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  28.39 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  25.87 
 
 		 699 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  28.32 
 
 		 782 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  32 
 
 		 189 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  72.55 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  64.71 
 
 		 772 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  35.29 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  33.33 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  54.72 
 
 		 855 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  40.96 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  68.29 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  58.49 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  38.55 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  49.06 
 
 		 1053 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  50 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 		 904 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  59.09 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  56.1 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  51.06 
 
 		 651 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  45.28 
 
 		 1054 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  25.41 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  48.15 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  24.31 
 
 		 1113 aa  57.4  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.55 
 
 		 600 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  34.07 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  51.06 
 
 		 1057 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  51.85 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  38.46 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  55.81 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  38.46 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.1 
 
 		 626 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  47.17 
 
 		 675 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  39.56 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  38.46 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  38.46 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  35.25 
 
 		 586 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  38.46 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  44.44 
 
 		 540 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  50 
 
 		 1577 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  41.51 
 
 		 1129 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  32.08 
 
 		 647 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  32.31 
 
 		 1260 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  35.29 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 		 578 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.82 
 
 		 699 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  32.67 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  46.81 
 
 		 1242 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  39.22 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  39.58 
 
 		 1127 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  39.58 
 
 		 1127 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  45.28 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>